در مقابل، بیشتر لیگازهای DNA یوکاریوتی، همراه با آنزیم های آرکیال و باکتریوفاژ، در زیر خانواده دوم قرار می گیرند. این آنزیم ها از ATP به عنوان کوفاکتور استفاده می کنند.
آیا لیگازها به ATP نیاز دارند؟
دو DNA لیگاز معمولا استفاده می شود. لیگاز T4 به ATP نیاز دارد در حالی که E.coli لیگاز به NAD+ نیاز دارد (نیکوتینامید آدنین دی نوکلئوتید کوآنزیمی است که از ۲ nt تشکیل شده است که از طریق گروه های فسفات به هم متصل شده اند.). هر دو اتصال یک گروه 5'-فسفات و یک گروه 3'-OH را کاتالیز می کنند تا یک پیوند فسفودی استر تشکیل دهند.
چرا لیگازها به ATP نیاز دارند؟
دو مرحله واکنش بستن DNA
واکنش بستن DNA خود دو مرحله اساسی دارد. ابتدا انتهای DNA باید تصادفی با هم برخورد کنند و به اندازه کافی با هم بمانند تا لیگاز به آنها بپیوندد. برای اینکه آنزیم بتواند واکنش های بیشتری را انجام دهد، AMP در محل فعال آنزیم باید توسط ATP پر شود.
وظیفه لیگازها چیست؟
لیگازهای DNA نقش اساسی در حفظ یکپارچگی ژنومی با پیوستن به شکستگی در ستون فقرات فسفودی استر DNA ایفا می کنند که در طول همانندسازی و نوترکیب رخ می دهد. تعمیر. سه ژن انسانی، LIG1، LIG3 و LIG4، لیگازهای DNA وابسته به ATP را رمزگذاری می‌کنند.
لیگازها چه هستند به صورت فعال یا غیرفعال عمل می کنند؟
DNA لیگاز در طول همانندسازی، ترمیم و فرآیند نوترکیب DNA فعال است. این به طور گسترده ای در تعمیر تک رشته استفاده می شودشکستن DNA دوتایی موجودات زنده با استفاده از رشته مکمل مارپیچ دوتایی به عنوان یک الگو، در حالی که برخی از اشکال ممکن است به طور خاص آسیب های دو رشته ای را ترمیم کنند.
