چه زمانی از همولوژی استفاده کنیم؟

فهرست مطالب:

چه زمانی از همولوژی استفاده کنیم؟
چه زمانی از همولوژی استفاده کنیم؟
Anonim

همچنین می‌توان از مدل‌های همسانی

برای شناسایی تفاوت‌های ظریف بین پروتئین‌های مرتبط که همه از نظر ساختاری حل نشده‌اند استفاده کرد. به عنوان مثال، این روش برای شناسایی مکان‌های اتصال کاتیونی در Na + /K+ ATPase و برای ارائه فرضیه‌هایی در مورد میل اتصال ATPaseهای مختلف استفاده شد..

مدل های همسانی برای چه مواردی استفاده می شود؟

مدل‌سازی هومولوژی یکی از روش‌های پیش‌بینی ساختار محاسباتی است که برای تعیین ساختار سه بعدی پروتئین از توالی اسید آمینه آن استفاده می‌شود. این روش دقیق ترین روش پیش بینی ساختار محاسباتی در نظر گرفته می شود. این شامل چندین مرحله است که ساده و کاربردی هستند.

مدل سازی همسانی چیست و چرا به آن نیاز است؟

مدل‌سازی همسانی ساختار سه‌بعدی پروتئین هدف را بر اساس شباهت بین الگو و دنباله‌های هدف به دست می‌آورد. مانند GPCR به سختی متبلور می شوند زیرا درک بالاتری از …

چگونه یک مدل همسانی انجام می دهید؟

مراحل مختلفی در مدل‌سازی همسانی وجود دارد

  1. انتخاب الگو با استفاده از دنباله هدف شما. برای این منظور می توانید جستجوی BLASTp را در برابر تمام ساختارهای پروتئینی موجود (PDB) انجام دهید. …
  2. ترازبندی الگو و دنباله هدف. …
  3. کیفیت مدل شما. …
  4. تصفیهمدل شما بر این اساس.

چه چیزی یک مدل سازی همسانی خوب را می سازد؟

اگر یک "مدل همسانی بسیار موفق" را به‌عنوان مدلی تعریف کنیم که دارای <=2 Å rmsd از ساختار تجربی است، پس الگو باید دارای >=60% هویت توالی با هدف برای موفقیت باشد. نرخ >70%. حتی در هویت‌های توالی بالا (60%-95%)، از هر ده مدل همسانی، یک مدل دارای rmsd >5 Å در مقابلاست.

توصیه شده:

مقالات جالب
آیا می توانید سوار بر قاچاقچیان باردار شوید؟
ادامه مطلب

آیا می توانید سوار بر قاچاقچیان باردار شوید؟

دیزنی توصیه می کند از سوار شدن به این جاذبه های استودیوهای هالیوود دیزنی در دوران بارداری: هزاره فالکون: قاچاقچیان دویدن . Rock 'n Roller Coaster. آیا Smuggler's Run برای بارداری بی خطر است؟ این یک ماجراجویی هیجان انگیز بود پر از هیجان و هیجان!

چگونه املای نامفهوم بنویسیم؟
ادامه مطلب

چگونه املای نامفهوم بنویسیم؟

صفت 1 درک یا درک نشده است. ما در حال ثبت تغییرات عظیمی هستیم که در جلوی چشمانمان رخ می دهد، غیرقابل درک. '… 2به دلیل جرم دستگیر نشدم. بعداً، نیکلاس اول به طور مشابه گسترش رعیت به سیبری را ممنوع کرد. هر رعیتی که می توانست بدون دستگیری فرار کند و در سیبری مستقر شود دهقان دولتی می شد.

چرا روابط بین دولتی مهم است؟
ادامه مطلب

چرا روابط بین دولتی مهم است؟

روابط بین دولتی در ایالات متحده تعامل بین دولت های ملی، ایالتی و محلی در سیستم سیاسی آمریکا را توصیف می کند. درک این روابط برای شخصی که در امور عمومی داخلی، به ویژه در سطح محلی کار می کند، حیاتی است. اصول روابط بین دولتی چیست؟ مقاله نتیجه می گیرد که اصول حاکمیت تعاونی و روابط بین دولتی اساساً بر اساس احترام متقابل، اعتماد و صداقت است.