مصنوعات دایمر پرایمر معمولاً در یک عدد سیکل آستانه بزرگ (معمولاً > 35 سیکل) رخ می دهد که بالاتر از عدد سیکل آستانه برای آمپلیکون مورد نظر است. هنگامی که DNA ژنومی هترولوگ اضافه می شود، دایمرهای پرایمر به طور قابل توجهی افزایش می یابند.
دایمرهای پرایمر روی ژل DNA را کجا می بینید؟
در PCR نقطه پایانی غیر کمی، دایمر پرایمر به صورت یک اسمیر کم و بیش ضعیف روی ژل آگارز، زیر باند محصول مورد علاقه ظاهر می شود.
دایمرهای آغازگر چگونه تشکیل می شوند؟
دایمرهای پرایمر به دلیل نواحی مکمل پرایمر، وقتی دو آغازگر به یکدیگر متصل می شوند، به جای DNA الگو، را تشکیل می دهند.
چگونه دایمرهای پرایمر را تشخیص می دهید؟
ساده ترین راه برای بررسی پرایمر-دایمرها مقایسه واکنش های خود با کنترل منفی شما (آب به جای DNA یا RNA) است. دایمرهای پرایمر همچنان در کنترل منفی تشکیل می شوند. برخی از مجموعه‌های پرایمر بیشتر از سایرین دایمر تشکیل می‌دهند.
چرا دایمرهای پرایمر ظاهر می شوند؟
بیشتر دایمرهای پرایمر به دلیل غلظت بالای پرایمر در مخلوط واکنش PCR دیده می شوند. یا اگر تقویت PCR وجود ندارد و می توانید روی دایمر پرایمر در ژل آگارز مشاهده کنید. اگر قادر به مشاهده محصول PCR هستید، می توانید غلظت پرایم را کاهش دهید و سایر شرایط را ثابت نگه دارید.
